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본청 소속

세관

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서울세관	구로지원센터 안양세관 천안세관 대산지원센터 청주세관 충주지원센터 대전세관 속초세관 고성지원센터 동해세관 원주지원센터 성남세관 파주세관 의정부지원센터 도라산지원센터
부산세관	김해공항세관 용당세관 부산국제우편지원센터 양산세관 창원세관 진해지원센터 마산세관 경남남부세관 통영지원센터 경남서부세관 사천지원센터
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산하 공공기관

소관기관

법제상 모든 세관은 관세청 직속기관이지만 본부세관은 권역 내의 세관에 대해 일부 사무를 수행하게 할 수 있다. 평택세관은 본부세관이 아니면서 관세청 직속기관으로 편입된 유일한 세관이다.