자치공화국(自治共和國)은 독립된 국가에 속하여 있으면서 대내적으로 한정된 자치권을 가지는 '국가 내 국가' 형태의 공화국이다. 일반적인 주(州)에 비해서 광범위하고 고도의 자치권을 부여받지만, 국제법상으로는 국가의 지위를 가지지 못한다.
대부분 소련의 영토 였으며, 대통령제 공화국 안에 있는 통령제 공화국들이다.
