피루브산 탈수소효소 키네이스 3

PDK3
사용 가능한 구조 PDB 동원체 검색: PDBe RCSB PDB ID 코드 목록 1Y8N, 1Y8O, 1Y8P, 2PNR, 2Q8I
식별자
다른 이름	PDK3, CMTX6, GS1-358P8.4, pyruvate dehydrogenase kinase 3
외부 ID	OMIM: 300906 MGI: 2384308 HomoloGene: 55897 GeneCards: PDK3
유전자 위치 (인간) 염색체 X 염색체 자리 Xp22.11 시작 24,465,244 bp 끝 24,550,466 bp
유전자 위치 (쥐) 염색체 X 염색체 (쥐) 자리 X|X C3 시작 92,808,213 bp 끝 92,875,807 bp
RNA 발현 패턴 Bgee 인간 쥐(동원체) 최상위 발현 middle temporal gyrus Brodmann area 23 부고환몸통 saphenous vein caput epididymis jejunal mucosa 내피세포 귀밑샘 정강뼈 두정엽 최상위 발현 spermatid endocardial cushion 세정관 근위 세뇨관 대구치 머리덮개뼈 신소체 심방 medullary collecting duct 콩팥 추가 참조 발현 데이터 BioGPS 추가 참조 발현 데이터
유전자 온톨로지 분자 함수 transferase activity nucleotide binding protein kinase activity kinase activity protein serine/threonine kinase activity 단백질 결합 ATP binding pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) kinase activity 세포 성분 미토콘드리아 기질 핵소체 미토콘드리아 생물학적 과정 인산화 peroxisome proliferator activated receptor signaling pathway hypoxia-inducible factor-1alpha signaling pathway regulation of reactive oxygen species metabolic process regulation of acetyl-CoA biosynthetic process from pyruvate regulation of glucose metabolic process cellular response to fatty acid peptidyl-serine phosphorylation glucose metabolic process cellular response to glucose stimulus 탄수화물 대사 출처: Amigo / QuickGO
동원체 종 인간 쥐 앙트레 5165 236900 앙상블 ENSG00000067992 ENSMUSG00000035232 유니프롯 Q15120 Q922H2 RefSeq (mRNA) NM_005391 NM_001142386 NM_145630 RefSeq(단백질) NP_001135858 NP_005382 NP_663605 위치(UCSC) Chr X: 24.47 – 24.55 Mb Chr X: 92.81 – 92.88 Mb PubMed 검색
위키데이터
인간 보기/편집 쥐 보기/편집

피루브산 탈수소효소 키네이스 3(영어: pyruvate dehydrogenase kinase 3, PDK3)는 사람에서 PDK3 유전자에 의해 암호화되는 효소이다. 피루브산 탈수소효소 리포아마이드 키네이스 동질효소 3, 미토콘드리아(영어: pyruvate dehydrogenase lipoamide kinase isozyme 3, mitochondrial)라고도 한다. PDK3는 피루브산 탈수소효소 키네이스(PDK)의 동질효소를 암호화한다. 피루브산 탈수소효소 복합체(PDC)는 피루브산이 아세틸-CoA 및 CO₂로 전환되는 전체 과정을 촉매하는 미토콘드리아 다중효소 복합체이다. 피루브산 탈수소효소 복합체는 해당과정과 시트르산 회로 사이를 연결하기 때문에 포도당 대사의 조절을 담당하는 주요 효소 중 하나이다. 피루브산 탈수소효소(PDH)의 효소 활성은 인산화 및 탈인산화에 의해 조절되며, 인산화로 인해 PDH가 비활성화된다. 이 유전자에 의해 암호화된 단백질은 E₁ α 소단위체의 인산화에 의해 PDH 복합체를 저해하는 4가지 피루브산 탈수소효소 키네이스 중 하나이다. 이 유전자는 주로 심장과 골격근에서 발현된다. 이 유전자에 대해 다른 동질형을 암호화하는 선택적 스플라이싱된 전사 변이체가 발견되었다.

구조

PDK3/L2 복합체의 구조가 밝혀졌으며 몇 가지 주요 특징이 있다. L2 도메인이 PDK3에 결합하면 PDK3에서 "교차 꼬리(cross-tail)" 입체구조를 유도하여 활성을 자극한다. C-말단 도메인에는 이러한 상호작용에 중요한 세 가지 중요 잔기인 Leu¹⁴⁰, Glu¹⁷⁰, Glu¹⁷⁹가 있다. 구조적 연구에 따르면 L2 결합은 닫힌 입체구조 또는 ATP 뚜껑의 파괴에 의한 활성을 자극하여 생성물 저해를 제거하는 것으로 나타났다. PDK3 소단위체는 두 가지 입체구조 중 하나이다. 하나의 소단위체는 "열린(open)" 소단위체로 존재하고, 다른 소단위체는 "닫힌(closed)" 소단위체로 존재한다. 열린 소단위체는 표적 펩타이드가 활성 중심에 접근할 수 있는 곳이기 때문에 추정 기질-결합 틈에 가장 중요한 입체배치이다. 닫힌 소단위체는 이웃한 풀린 α 나선으로 인해 이 표적 펩타이드를 차단한다. 추가적으로, 하나의 PDK3 소단위체의 ATP 결합 루프는 열린 입체구조를 채택하는 데, 이는 활성 부위로의 뉴클레오타이드 로딩이 비활성 "사전 삽입()" 결합 모드에 의해 매개됨을 의미한다. 이 비대칭 복합체는 단일 L2 도메인의 결합이 피루브산 탈수소효소 키네이스(PDK) 소단위체 중 하나를 활성화하고 다른 소단위체는 비활성화하는 생리학적 상태를 나타낸다. 따라서 L2 도메인은 구조적 앵커 역할을 할 뿐만 아니라 PDK3의 촉매 주기를 조절하는 것으로 보인다.

기능

피루브산 탈수소효소 복합체(PDC)는 일반적인 대사에서 중심적인 역할을 하기 때문에 엄격하게 조절되어야 한다. 피루브산 탈수소효소 복합체 내에는 E₁ 성분에 인산화 부위인 3개의 세린 잔기가 있다. 이 인산화는 복합체를 비활성화시킨다. 사람에서는 PDK1, PDK2, PDK3, PDK4의 3가지 부위를 인산화하는 것으로 밝혀진 피루브산 탈수소효소 키네이스의 4가지 동질효소가 있다. PDK3 단백질은 주로 콩팥, 뇌, 고환에서 발견된다.

조절

중심 대사 경로의 중요한 단계의 주요 조절자로서 피루브산 탈수소효소 패밀리는 수많은 요인들에 의해 자체적으로 엄격하게 조절된다. PDK3는 PDK2 및 PDK4와 함께 퍼옥시좀 증식인자 활성화 수용체 델타 또는 베타(PPAR β 또는 Δ)의 주요 표적이며, PDK3는 이러한 수용체에 반응하는 5가지 요소를 가지고 있다.

같이 보기

• 피루브산 탈수소효소 키네이스 (PDK)
• 피루브산 탈수소효소 키네이스 1 (PDK1)
• 피루브산 탈수소효소 키네이스 2 (PDK2)
• 피루브산 탈수소효소 키네이스 4 (PDK4)

더 읽을거리

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