CEBPB
CCAAT/증폭자 결합 단백질 베타(CCAAT/enhancer-binding protein beta)는 인간의 CEBPB 유전자에 의해 암호화 된 단백질이다.[5][6]
기능
[편집]인트론이 없는 유전자에 의해 암호화 된 단백질은 특정 DNA 조절 영역에 동종 이량체로서 결합 할 수 있는 bZIP 전사인자이다. 또한 관련 단백질 CEBP-알파, CEBP-델타, CEBP-감마와 함께 이종 이량체를 형성 할 수 있다. 암호화 된 단백질은 면역 및 염증 반응에 관여하는 유전자의 조절에 중요하며, IL-6 유전자의 IL-1 반응 요소 및 몇몇 급성기, 사이토카인 유전자의 조절 영역에 결합하는 것으로 나타났다. 또한 암호화 된 단백질은 프로모터 및 상류 요소에 결합하여 제 1형 콜라겐 유전자의 발현을 자극 할 수 있다.[7]
CEBP-베타는 정상적인 대식세포 기능, 중요한 면역 세포 아형에 중요하다. CEBP-베타를 발현 할 수 없는 쥐는 대식세포-매개 근육 복구를 포함하여 분화 할 수 없고, 이들의 모든 생물학적 기능을 수행할 수 없는 대식세포를 갖는다.[8] 역학 작업은 혈액의 백혈구에서 CEBP-베타의 발현이 인간의 근력과 긍정적으로 관련되어 있음을 보여 주었고[9], 근육 기능 유지에 있어 면역계, 특히 대식세포의 중요성을 강조하고 있다.
CEBPB 유전자의 기능은 독립적 인 검증에 기초하여 siRNA 녹다운에 의해 효과적으로 검사 될 수있다.[10]
표적 유전자
[편집]CEBPB는 여러 표적 유전자의 발현을 증가시킬 수 있다. 그 중 일부는 preprotachykinin-1 유전자와 같은 신경계에서 특정 역할을 담당하여 물질 P, 뉴로키닌 A[11], 중요한 신경전달물질인 아세틸콜린의 생합성을 담당하는 콜린아세틸트린스퍼레이스를 유발시킨다.[12] 다른 표적은 인터루킨 4[13], 인터루킨 6[14], 인터루킨 5[15], 종양괴사인자 알파와 같은 사이토카인을 암호화하는 유전자를 포함한다.[16] 또한 세포에 다약제내성을 부여하는 수송 단백질을 암호화하는 유전자는 CEBPB에 의해 활성화되는 것으로 밝혀졌다. 이러한 유전자에는 ABCC2[17] 및 ABCB1이 포함된다.[18]
상호 작용
[편집]CEBPB는 다음과 상호 작용하는 것으로 나타났다.
- CREB1,[19]
- CRSP3[20]
- DNA damage-inducible transcript 3,[21][22]
- EP300,[23]
- Estrogen receptor alpha,[24][25]
- Glucocorticoid receptor,[24]
- HMGA1,[26]
- HSF1,[27]
- Nucleolar phosphoprotein p130,[28]
- RELA,[29][30]
- Serum response factor,[31][32]
- SMARCA2,[33]
- Sp1 transcription factor,[26][34]
- TRIM28,[35][36] and
- Zif268.[37]
각주
[편집]- ↑ 가 나 다 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000172216 - 앙상블, May 2017
- ↑ 가 나 다 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000056501 - 앙상블, May 2017
- ↑ “Human PubMed Reference:”. 《National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine》.
- ↑ “Mouse PubMed Reference:”. 《National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine》.
- ↑ “Chromosomal localization in man and rat of the genes encoding the liver-enriched transcription factors C/EBP, DBP, and HNF1/LFB-1 (CEBP, DBP, and transcription factor 1, TCF1, respectively) and of the hepatocyte growth factor/scatter factor gene (HGF)”. 《Genomics》 13 (2): 293–300. Jul 1992. doi:10.1016/0888-7543(92)90245-N. PMID 1535333.
- ↑ “Regulated expression of three C/EBP isoforms during adipose conversion of 3T3-L1 cells”. 《Genes Dev》 5 (9): 1538–52. Oct 1991. doi:10.1101/gad.5.9.1538. PMID 1840554.
- ↑ “Entrez Gene: CEBPB CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), beta”.
- ↑ “A CREB-C/EBPbeta cascade induces M2 macrophage-specific gene expression and promotes muscle injury repair”. 《Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.》 106 (41): 17475–80. 2009. doi:10.1073/pnas.0908641106. PMC 2762675. PMID 19805133.
- ↑ “CCAAT-enhancer-binding protein-beta expression in vivo is associated with muscle strength”. 《Aging Cell》 11 (2): 262–8. 2012. doi:10.1111/j.1474-9726.2011.00782.x. PMC 3486692. PMID 22152057.
- ↑ Munkácsy, Gyöngyi; Sztupinszki, Zsófia; Herman, Péter; Bán, Bence; Pénzváltó, Zsófia; Szarvas, Nóra; Győrffy, Balázs (2016년 1월 1일). “Validation of RNAi Silencing Efficiency Using Gene Array Data shows 18.5% Failure Rate across 429 Independent Experiments”. 《Molecular Therapy - Nucleic Acids》 (영어) 5 (9): e366. doi:10.1038/mtna.2016.66. ISSN 2162-2531. PMC 5056990. PMID 27673562.
- ↑ “C/EBPbeta couples dopamine signalling to substance P precursor gene expression in striatal neurones”. 《J. Neurochem.》 98 (5): 1390–9. September 2006. doi:10.1111/j.1471-4159.2006.03957.x. PMID 16771829.
- ↑ “Synergistic activation of the human choline acetyltransferase gene by c-Myb and C/EBPbeta”. 《Brain Res. Mol. Brain Res.》 106 (1–2): 124–35. October 2002. doi:10.1016/S0169-328X(02)00419-9. PMID 12393272.
- ↑ “Macrophage differentiation-specific expression of NF-IL6, a transcription factor for interleukin-6”. 《Blood》 79 (2): 460–6. January 1992. PMID 1730090.
- ↑ “Nuclear factor-IL6 activates the human IL-4 promoter in T cells”. 《J. Immunol.》 155 (11): 5273–9. December 1995. PMID 7594540.
- ↑ “A composite C/EBP binding site is essential for the activity of the promoter of the IL-3/IL-5/granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor beta c gene”. 《J. Immunol.》 163 (5): 2674–80. September 1999. PMID 10453008.
- ↑ “Tumor Necrosis Factor Alpha Inhibits Type I Collagen Synthesis through Repressive CCAAT/Enhancer-Binding Proteins”. 《Mol. Cell. Biol.》 20 (3): 912–8. February 2000. doi:10.1128/MCB.20.3.912-918.2000. PMC 85208. PMID 10629048.
- ↑ “The human multidrug resistance protein 2 gene: functional characterization of the 5'-flanking region and expression in hepatic cells”. 《Hepatology》 30 (6): 1507–12. December 1999. doi:10.1002/hep.510300617. PMID 10573531.
- ↑ “CCAAT/enhancer-binding protein beta (nuclear factor for interleukin 6) transactivates the human MDR1 gene by interaction with an inverted CCAAT box in human cancer cells”. 《Mol. Pharmacol.》 65 (4): 906–16. April 2004. doi:10.1124/mol.65.4.906. PMID 15044620.
- ↑ Chen Y, Zhuang S, Cassenaer S, Casteel DE, Gudi T, Boss GR, Pilz RB (2003). “Synergism between calcium and cyclic GMP in cyclic AMP response element-dependent transcriptional regulation requires cooperation between CREB and C/EBP-beta”. 《Mol. Cell. Biol.》 23 (12): 4066–82. doi:10.1128/mcb.23.12.4066-4082.2003. PMC 156132. PMID 12773552.
- ↑ Mo X, Kowenz-Leutz E, Xu H, Leutz A (January 2004). “Ras induces mediator complex exchange on C/EBP beta”. 《Mol. Cell》 13 (2): 241–50. doi:10.1016/s1097-2765(03)00521-5. PMID 14759369.
- ↑ Hattori T, Ohoka N, Hayashi H, Onozaki K (April 2003). “C/EBP homologous protein (CHOP) up-regulates IL-6 transcription by trapping negative regulating NF-IL6 isoform”. 《FEBS Lett.》 541 (1–3): 33–9. doi:10.1016/s0014-5793(03)00283-7. PMID 12706815.
- ↑ Fawcett TW, Eastman HB, Martindale JL, Holbrook NJ (June 1996). “Physical and functional association between GADD153 and CCAAT/enhancer-binding protein beta during cellular stress”. 《J. Biol. Chem.》 271 (24): 14285–9. doi:10.1074/jbc.271.24.14285. PMID 8662954.
- ↑ Mink S, Haenig B, Klempnauer KH (November 1997). “Interaction and functional collaboration of p300 and C/EBPbeta”. 《Mol. Cell. Biol.》 17 (11): 6609–17. doi:10.1128/mcb.17.11.6609. PMC 232514. PMID 9343424.
- ↑ 가 나 Boruk M, Savory JG, Haché RJ (November 1998). “AF-2-dependent potentiation of CCAAT enhancer binding protein beta-mediated transcriptional activation by glucocorticoid receptor”. 《Mol. Endocrinol.》 12 (11): 1749–63. doi:10.1210/mend.12.11.0191. PMID 9817600.
- ↑ Stein B, Yang MX (September 1995). “Repression of the interleukin-6 promoter by estrogen receptor is mediated by NF-kappa B and C/EBP beta”. 《Mol. Cell. Biol.》 15 (9): 4971–9. doi:10.1128/mcb.15.9.4971. PMC 230744. PMID 7651415.
- ↑ 가 나 Foti D, Iuliano R, Chiefari E, Brunetti A (2003). “A nucleoprotein complex containing Sp1, C/EBP beta, and HMGI-Y controls human insulin receptor gene transcription”. 《Mol. Cell. Biol.》 23 (8): 2720–32. doi:10.1128/mcb.23.8.2720-2732.2003. PMC 152545. PMID 12665574.
- ↑ Xie Y, Chen C, Stevenson MA, Auron PE, Calderwood SK (April 2002). “Heat shock factor 1 represses transcription of the IL-1beta gene through physical interaction with the nuclear factor of interleukin 6”. 《J. Biol. Chem.》 277 (14): 11802–10. doi:10.1074/jbc.M109296200. PMID 11801594.
- ↑ Miau LH, Chang CJ, Shen BJ, Tsai WH, Lee SC (April 1998). “Identification of heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K (hnRNP K) as a repressor of C/EBPbeta-mediated gene activation”. 《J. Biol. Chem.》 273 (17): 10784–91. doi:10.1074/jbc.273.17.10784. PMID 9553145.
- ↑ Weber M, Sydlik C, Quirling M, Nothdurfter C, Zwergal A, Heiss P, Bell S, Neumeier D, Ziegler-Heitbrock HW, Brand K (June 2003). “Transcriptional inhibition of interleukin-8 expression in tumor necrosis factor-tolerant cells: evidence for involvement of C/EBP beta”. 《J. Biol. Chem.》 278 (26): 23586–93. doi:10.1074/jbc.M211646200. PMID 12707271.
- ↑ Xia C, Cheshire JK, Patel H, Woo P (December 1997). “Cross-talk between transcription factors NF-kappa B and C/EBP in the transcriptional regulation of genes”. 《Int. J. Biochem. Cell Biol.》 29 (12): 1525–39. doi:10.1016/s1357-2725(97)00083-6. PMID 9570146.
- ↑ Hanlon M, Sealy L (May 1999). “Ras regulates the association of serum response factor and CCAAT/enhancer-binding protein beta”. 《J. Biol. Chem.》 274 (20): 14224–8. doi:10.1074/jbc.274.20.14224. PMID 10318842.
- ↑ Sealy L, Malone D, Pawlak M (March 1997). “Regulation of the cfos serum response element by C/EBPbeta”. 《Mol. Cell. Biol.》 17 (3): 1744–55. doi:10.1128/mcb.17.3.1744. PMC 231899. PMID 9032301.
- ↑ Kowenz-Leutz E, Leutz A (November 1999). “A C/EBP beta isoform recruits the SWI/SNF complex to activate myeloid genes”. 《Mol. Cell》 4 (5): 735–43. doi:10.1016/s1097-2765(00)80384-6. PMID 10619021.
- ↑ Liu YW, Tseng HP, Chen LC, Chen BK, Chang WC (July 2003). “Functional cooperation of simian virus 40 promoter factor 1 and CCAAT/enhancer-binding protein beta and delta in lipopolysaccharide-induced gene activation of IL-10 in mouse macrophages”. 《J. Immunol.》 171 (2): 821–8. doi:10.4049/jimmunol.171.2.821. PMID 12847250.
- ↑ Rooney JW, Calame KL (2001). “TIF1beta functions as a coactivator for C/EBPbeta and is required for induced differentiation in the myelomonocytic cell line U937”. 《Genes Dev.》 15 (22): 3023–38. doi:10.1101/gad.937201. PMC 312827. PMID 11711437.
- ↑ Chang CJ, Chen YL, Lee SC (October 1998). “Coactivator TIF1beta interacts with transcription factor C/EBPbeta and glucocorticoid receptor to induce alpha1-acid glycoprotein gene expression”. 《Mol. Cell. Biol.》 18 (10): 5880–7. doi:10.1128/mcb.18.10.5880. PMC 109174. PMID 9742105.
- ↑ Zhang F, Lin M, Abidi P, Thiel G, Liu J (November 2003). “Specific interaction of Egr1 and c/EBPbeta leads to the transcriptional activation of the human low density lipoprotein receptor gene”. 《J. Biol. Chem.》 278 (45): 44246–54. doi:10.1074/jbc.M305564200. PMID 12947119.