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아래 분류는 현재 개정중에 있다.<ref name="Cyanophyceae cladistics">{{웹 인용 | 제목 = Cyanophyceae |url=http://www.accessscience.com/content/Cyanophyceae/175300 | 작품 = Cyanophyceae | 출판사=Access Science |확인일자확인날짜=2011년 4월 21일}}</ref><ref>{{저널 인용 | 저자 = Ahoren Oren | 연도 = 2004 | 제목 = A proposal for further integration of the cyanobacteria under the Bacteriological Code| 저널 = Int. J. Syst. Evol. Microbiol. |volume=54 | 쪽 =1895?1902 |doi=10.1099/ijs.0.03008-0 |pmid=15388760 |issue=Pt 5}}</ref>
* Gloeobacteria
** Gloeobacteria

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