인도네시아의 행정 구역은 총 38개의 주로 구성되어 있다. 이 가운데 아체주, 욕야카르타 특별주, 자카르타 3개 주와 서뉴기니의 6개 주는 특별주로 지정되어 있다.
- 서뉴기니(Western New Guinea, 서파푸아(West Papua), 뉴기니섬의 서반부 지역)
- 서파푸아주(Papua Barat, 옛 이름은 서이리안자야주(Irian Jaya Barat))
- 남서파푸아주(Papua Barat Daya), 2022년 서파푸아주에서 분리되어 신설
- 파푸아주(Papua, 옛 이름은 이리안자야주(Irian Jaya))
- 중앙파푸아주(Papua Tengah), 2022년 파푸아주에서 분리되어 신설
- 파푸아고원주(Papua Pegunungan), 2022년 파푸아주에서 분리되어 신설
- 남파푸아주(Papua Selatan), 2022년 파푸아주에서 분리되어 신설
- 술라웨시섬(Sulawesi)
- 대볼랑몽온도우주(Bolaang Mongondow Raya), 출처 지역은 북술라웨시주이다.
- 칼리만탄(Kalimantan, 보르네오섬의 인도네시아 영토)
- 특별수도지역(Daerah Khusus Ibu Kota Negara, 누산타라), 출처 지역은 동칼리만탄주이다.
- 대카푸아스주(Kapuas Raya), 출처 지역은 서칼리만탄주이다.
- 탄중푸라주(Tanjungpura), 출처 지역은 서칼리만탄주이다.
- 대바리토주(Barito Raya), 출처 지역은 중앙칼리만탄주이다.
- 코타와링인주(Kotawaringin), 출처 지역은 중앙칼리만탄주이다.