TAE 완충용액

TAE 완충용액(TAE 버퍼, TAE buffer)은 Tris 염기, 아세트산 및 EDTA으로 구성된 완충액이다.

분자 생물학에서는 일반적으로 DNA 및 RNA와 같은 핵산의 분리를 위해 아가로스 전기영동에 사용된다.^[1] 일반적으로 pH 8.3의 Tris-acetate 완충액과 2가 양이온을 격리하는 EDTA로 구성된다. TAE는 TBE보다 완충 용량이 낮고 쉽게 고갈될 수 있지만 선형 이중 가닥 DNA는 TAE에서 더 빠르게 실행된다.

이전에 Brody & Kern은 겔 시스템에서 보다 효율적이고 저렴한 전도성 매체를 TBE 및 TAE 완충용액으로 대체하여 전기영동 버퍼를 단순화했다.^[2]

사용

TAE(Tris-acetate-EDTA) 완충액은 실행 완충액과 아가로스 겔 모두로 사용된다.^[3] 광범위한 돌연변이 분석을 위한 변성 구배 겔 전기영동 방법에서의 사용도 설명되었다.^[4] TAE는 염화 나트륨이 있거나 없는 용액에서 DNA의 이동성을 연구하기 위해 다양한 농도에서 사용되었다.^[5] 그러나 DNA 샘플에서 높은 농도의 염화 나트륨(및 기타 많은 염)은 이동성을 지연시킨다. 이것은 결과 DNA 밴딩 패턴의 잘못된 해석으로 이어질 수 있다.

구성

TAE 완충용액은 일반적으로 실험실 사용을 위한 50x 스톡 용액으로 준비된다. 50x 스톡 용액은 물에 242g의 Tris 염기를 용해하고 57.1ml의 아세트산 및 100ml의 50mM EDTA(pH 8.0) 용액을 첨가하고 최종 부피를 1리터까지 만들어 준비할 수 있다. 이 스톡 용액은 1X 작업 용액을 만들기 위해 물로 49:1 희석될 수 있다. 이 1x 용액은 40mM Tris, 20mM 아세트산 및 1mM EDTA를 포함한다.

No.	종류	Per 1 mole	Main solution	50×	1× solution	1X
1	Tris base	121.1 g/L	2 M	242.2 g/L	40 mM	4.844 g/L
2	acetic acid	57.1 ml/L	1 M	57.1 ml/L	20 mM	1.21 ml/L
3	EDTA disodium salt dihydrate	372.24 g/L	50 mM	18.612 g/L	1 mM	0.372 g/L

2M = 2000mM이므로 1x의 경우 2000mM /50 = 40mM이다.
1M = 1000mM이므로 1x의 경우 1000mM /50 = 30mM이다.
50mM /50 = 1x의 경우 1mM이다.

먼저 이 성분들을 500ml에 녹여 1000ml로 한다. 참고로 EDTA는 용해하는 데 더 많은 시간이 걸리므로 EDTA를 용해하는 동안 교반기를 사용하는 것이 좋다(3~4회에 소량의 EDTA). 50× TAE 완충용액의 준비 방법에 대한 단계별 레시피는 protocol.io.^[6]에서 확인할 수 있다.

비슷한 종류의 용액

TA 완충용액

이름 그대로 TAE 완충용액의 E인 EDTA가 빠진 용액이다.^{[출처 필요]}

TBE 완충용액

이름 그대로 TAE 완충용액의 A인 acetic acid가 boric acid의 B로 바뀐 용액이다.^[7]

같이 보기

완충 용액
TBE buffer
LB buffer
전기영동

각주

↑ Ogden, R.C., and Adams, D.A., (1987) Electrophoresis in agarose and acrylamide gels. Methods Enzymol., 152:, 61-87.
↑ Brody, Jonathan R.; Kern, Scott E. (2004년 10월). “History and principles of conductive media for standard DNA electrophoresis”. 《Analytical Biochemistry》 (영어) 333 (1): 1–13. doi:10.1016/j.ab.2004.05.054.
↑ Sambrook, Fritsch, and Maniatis (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York, volume 3, apendices B.11 and B.23 ISBN 0-87969-309-6
↑ Hayes, V.M. et al., (1999) Improvements in gel composition and electrophoretic conditions for broad-range mutation analysis by denaturing gradient gel electrophoresis. Nucleic Acids Res., 27(20): e29. PMID 10497279
↑ Stellwagen, E., and Stellwagen, N.C. (2002) The free solution mobility of DNA in Tris-acetate-EDTA buffers of different concentrations, with and without added NaCl. Electrophoresis, 23(12): 1935-1941. PMID 12116139
↑ Behle, Anna; Pawlowski, Alice. “Recipe for 50x TAE buffer v1”. doi:10.17504/protocols.io.gtvbwn6.
↑ “History and principles of conductive media for standard DNA electrophoresis” (PDF). doi:10.1016/j.ab.2004.05.054.

[1] Ogden, R.C., and Adams, D.A., (1987) Electrophoresis in agarose and acrylamide gels. Methods Enzymol., 152:, 61-87.

[2] Brody, Jonathan R.; Kern, Scott E. (2004년 10월). “History and principles of conductive media for standard DNA electrophoresis”. 《Analytical Biochemistry》 (영어) 333 (1): 1–13. doi:10.1016/j.ab.2004.05.054.

[3] Sambrook, Fritsch, and Maniatis (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York, volume 3, apendices B.11 and B.23 ISBN 0-87969-309-6

[4] Hayes, V.M. et al., (1999) Improvements in gel composition and electrophoretic conditions for broad-range mutation analysis by denaturing gradient gel electrophoresis. Nucleic Acids Res., 27(20): e29. PMID 10497279

[5] Stellwagen, E., and Stellwagen, N.C. (2002) The free solution mobility of DNA in Tris-acetate-EDTA buffers of different concentrations, with and without added NaCl. Electrophoresis, 23(12): 1935-1941. PMID 12116139

[6] Behle, Anna; Pawlowski, Alice. “Recipe for 50x TAE buffer v1”. doi:10.17504/protocols.io.gtvbwn6.

[7] “History and principles of conductive media for standard DNA electrophoresis” (PDF). doi:10.1016/j.ab.2004.05.054.

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