OmpA 유사 막관통 도메인
| OmpA-like transmembrane domain | |||||||||
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| 식별자 | |||||||||
| 상징 | OmpA_membrane | ||||||||
| Pfam | PF01389 | ||||||||
| Pfam clan | CL0193 | ||||||||
| InterPro | IPR000498 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00819 | ||||||||
| SCOP | 1bxw | ||||||||
| SUPERFAMILY | 1bxw | ||||||||
| TCDB | 1.B.6 | ||||||||
| OPM superfamily | 26 | ||||||||
| OPM protein | 1qjp | ||||||||
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OmpA 유사 막관통 도메인(OmpA-like Transmembrane Domain)은 세균 외막 단백질의 진화적으로 보존된 단백질 도메인이다. 이 도메인은 8개 가닥의 베타 배럴로 구성된다.[1] OmpA는 세포당 약 100,000개 사본에서 발견되는 장 내 세균의 주된 세포 표면 항원이다.[2] OmpA의 발현은 다양한 메커니즘에 의해 엄격하게 조절된다. 비브리오 종에서 OmpA 발현이 조절되는 메커니즘 중 하나는 VrrA라고 하는 안티센스 비암호화 RNA에 의한 것이다.[3]
구조
[편집]구조는 8가닥의 상하 베타 배럴로 구성된다. 가닥은 4개의 세포 외 루프와 3개의 세포 내 회전으로 연결된다.[4]
기능
[편집]수많은 OmpA 유사 막 스패닝 도메인은 숙주 세포 또는 인자 H와 같은 면역 조절자에 대한 결합과 같은 다양한 메커니즘에 의해 세균 독성에 기여한다. 주목할만한 예로는 E. coli OmpA 및 페스트균 Ail이 있다. 이러한 단백질 중 몇 가지는 백신 후보로 속한다.
E. coli OmpA는 뇌 미세혈관 내피 세포에서 인간 당단백질 Ecgp와 특정 상호작용을 하는 것으로 나타났다.[5] Cronobacter <i id="mwJg">sakazakii</i>는 신생아에서 뇌수막염을 일으키는 식품 매개 병원체이며 OmpA를 통해 피브로넥틴에 결합하는 것으로 나타났으며 이는 혈액뇌장벽의 침입에 중요한 역할을 한다.[6] Y. pestis 단백질 Ail은 라미닌과 헤파린에 결합하여 세균이 숙주 세포에 부착되도록 한다.[7] Borrelia afzelii 단백질 BAPKO_0422는 OmpA 유사 막관통 도메인이며 인간 인자 H에 결합한다.[8]
참고
[편집]- OmpA 도메인
각주
[편집]- ↑ “Structure of the outer membrane protein A transmembrane domain”. 《Nature Structural Biology》 5 (11): 1013–7. Nov 1998. doi:10.1038/2983. PMID 9808047.
- ↑ “A molecular Swiss army knife: OmpA structure, function and expression”. 《FEMS Microbiology Letters》 273 (1): 1–11. Aug 2007. doi:10.1111/j.1574-6968.2007.00778.x. PMID 17559395.
- ↑ “A novel sRNA that modulates virulence and environmental fitness of Vibrio cholerae”. 《RNA Biology》 6 (3): 254–8. July 2009. doi:10.4161/rna.6.3.8371. PMID 19411843.
- ↑ “NMR structure of the integral membrane protein OmpX”. 《Journal of Molecular Biology》 336 (5): 1211–21. Mar 2004. doi:10.1016/j.jmb.2003.09.014. PMID 15037080.
- ↑ “Cloning and expression of the Escherichia coli K1 outer membrane protein A receptor, a gp96 homologue”. 《Infection and Immunity》 71 (4): 1680–8. Apr 2003. doi:10.1128/IAI.71.4.1680-1688.2003. PMC 152083. PMID 12654781.
- ↑ “Outer membrane protein A (OmpA) of Cronobacter sakazakii binds fibronectin and contributes to invasion of human brain microvascular endothelial cells”. 《Foodborne Pathogens and Disease》 6 (4): 495–501. May 2009. doi:10.1089/fpd.2008.0228. PMID 19415974.
- ↑ “Structural insights into Ail-mediated adhesion in Yersinia pestis”. 《Structure》 19 (11): 1672–82. Nov 2011. doi:10.1016/j.str.2011.08.010. PMC 3217190. PMID 22078566.
- ↑ “The Borrelia afzelii outer membrane protein BAPKO_0422 binds human factor-H and is predicted to form a membrane-spanning β-barrel”. 《Bioscience Reports》 35 (4): e00240. 2015. doi:10.1042/BSR20150095. PMC 4613713. PMID 26181365.