FASTA 포맷

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FASTA 포맷
파일 확장자.fasta, .fna, .ffn, .faa, .frn, .fa
인터넷 미디어 타입
text/x-fasta
UTI아니오
개발David J. Lipman
William R. Pearson[1][2]
발표일1985
포맷 종류생물정보학
다음으로부터 확장ASCII (FASTA용)
다음으로 확장FASTQ 포맷[3]
웹사이트www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/fasta.shtml

FASTA 포맷염기서열 혹은 단백질서열을 문자열로 표현한 것이다. 이 포맷은 FASTA 소프트웨어 패키지가 기원이지만 현재는 생물정보학 분야에서 표준에 가깝게 사용되고 있다.[4]

각주[편집]

  1. Lipman DJ, Pearson WR (March 1985). “Rapid and sensitive protein similarity searches”. 《Science》 227 (4693): 1435–41. Bibcode:1985Sci...227.1435L. doi:10.1126/science.2983426. PMID 2983426.  클로즈드 액세스
  2. Pearson WR, Lipman DJ (April 1988). “Improved tools for biological sequence comparison”. 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 85 (8): 2444–8. Bibcode:1988PNAS...85.2444P. doi:10.1073/pnas.85.8.2444. PMC 280013. PMID 3162770. 
  3. Cock PJ, Fields CJ, Goto N, Heuer ML, Rice PM (April 2010). “The Sanger FASTQ file format for sequences with quality scores, and the Solexa/Illumina FASTQ variants”. 《Nucleic Acids Research》 38 (6): 1767–71. doi:10.1093/nar/gkp1137. PMC 2847217. PMID 20015970. 
  4. “What is FASTA Format?”. 《zhanglab.ccmb.med.umich.edu》.  explains the FASTA format

외부 링크[편집]