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나노호염고세균: 두 판 사이의 차이

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2023년 2월월 23일 (목) 12:35 판

나노호염고세균
생물 분류ℹ️
아강: "Nanohaloarchaeota"
모식종
DPANN
[출처 필요]
Nanohaloarchaea
Scientific classification
Domain:
Archaea
Superphylum:
DPANN
Phylum:
"Nanohaloarchaeota"
Class:
"Nanohaloarchaea"


(sic) Narasingarao et al. 2012
Order:
"Nanohalarchaeales"
Family:
"Nanohalarchaeaceae"
Genus
  • "Candidatus Nanohalarchaeum" corrig. Hamm et al. 2019
Synonyms
  • "Nanohalarchaeia" corrig. Narasingarao et al. 2012

나노호염고세균(Nanohaloarchaea)은 DPANN 고세균에 속하는 작은 게놈과 제한된 대사 능력을 가지는 고세균의 일부 분기군이다. 이들은 고농도 염분 서식지에 널리 존재하는데, 여기에는 극호염성인 할로고세균도 존재한다.

나노호염고세균은 메타게노믹(metagenomic) 데이터에서 6개 분기군으로 구성된 미배양 호염성 고세균의 한 부류로 처음으로 확인되었으며,[1][2] 이어서 Diapherotrites, Parvarchaeota, Aenigmarchaeota, Nanoarchaeota, Nanohaloarchaeota( DPANN ) 슈퍼 문(super-phylum) 내의 Nanohaloarchaeota 문에 배치되었다.[3] 그러나 나노할로고세균의 계통발생학적 위치는 여전히 논쟁의 여지가 많아서, 호염고세균의 자매 계통 또는 DPANN 슈퍼 문(super-phylum)의 구성원으로 제안되기도 한다.[4][5][6]

이후 호주의 탈라소할린(thalassohaline) 호수, [7] 스페인 염전, [8] 러시아 소다 염수,[9] 캘리포니아 염전,[10] 및 칠레 암염[11]을 포함하는 다양한 고염분 환경의 데이터에서 그 혈통이 확인되었다.

분류

현재 인정되는 분류는 LPSN(List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature) [12] 및 NCBI( National Center for Biotechnology Information )에 기초를 두고 있다.[13]

 
 

"Candidatus Nanosalinicola"

 
 
 

"Candidatus Nanosalina"

 
 

"Candidatus Nanohalobium"

 
 
 

Phylum "Nanohaloarchaeota" corrig. Rinkeet al. 2013년

  • Class "Nanohaloarchaeia" corrig. Narasingarao et al. 2012
    • Order "Nanohaloarchaeales"
      • Family "Nanohaloarchaeaceae"
        • Genus ?"Candidatus Nanohaloarchaeum" corrig. Hamm et al. 2019
          • "Ca. N. antarcticum" corrig. Hamm et al. 2019
  • Class "Nanohalobiia" corrig. La Cono et al. 2020
    • Order "Nanohalobiales" La Cono et al. 2020[14] ["Nanosalinales" Rinke et al. 2020]
      • Family "Nanohalobiaceae" La Cono et al. 2020 ["Nanosalinaceae" Rinke et al. 2020]
        • Genus ?"Candidatus Haloredivivus" Ghai et al. 2011
        • Genus ?"Candidatus Nanopetraeus" corrig. Crits‐Christoph et al. 2016 ["Nanopetramus" (sic)]
        • Genus "Candidatus Nanohalobium" La Cono et al. 2020
          • "Ca. N. constans" La Cono et al. 2020
        • Genus "Candidatus Nanosalina" Narasingarao et al. 2012
        • Genus "Candidatus Nanosalinicola" corrig. Narasingarao et al. 2012 ["Nanosalinarum" (sic)]

참고 문헌

추가 자료

  1. ↑ Narasingarao; 외. (2011). “De novo metagenomic assembly reveals abundant novel major lineage of Archaea in hypersaline microbial communities”. 《ISME J.》 6 (1): 81–93. doi:10.1038/ismej.2011.78. PMC 3246234. PMID 21716304. 
  2. ↑ Ghai, Rohit; Lejla Pašić; Ana Beatriz Fernandez; Ana-Belen Martin-Cuadrado; 외. (2011년 10월 10일). “New Abundant Microbial Groups in Aquatic Hypersaline Environments”. 《Scientific Reports》 1: 135. Bibcode:2011NatSR...1E.135G. doi:10.1038/srep00135. PMC 3216616. PMID 22355652. 
  3. ↑ Rinke C, Schwientek P, Sczyrba A, Ivanova NN, Anderson IJ, Cheng JF, Darling A, Malfatti S, Swan BK, Gies EA, Dodsworth JA, Hedlund BP, Tsiamis G, Sievert SM, Liu WT, Eisen JA, Hallam SJ, Kyrpides NC, Stepanauskas R, Rubin EM, Hugenholtz P, Woyke T (2013년 7월 25일). “Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter”. 《Nature》. 499, 431–437 (2013) (7459): 431–437. Bibcode:2013Natur.499..431R. doi:10.1038/nature12352. PMID 23851394. 
  4. ↑ Petitjean, C.; Deschamps, P.; López-García, P.; Moreira, D. (2014). “Rooting the domain Archaea by phylogenomic analysis supports the foundation of the new kingdom Proteoarchaeota”. 《Genome Biol. Evol.》 7 (1): 191–204. doi:10.1093/gbe/evu274. PMC 4316627. PMID 25527841. 
  5. ↑ Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E-Yung (2020). “Multidomain ribosomal protein trees and the planctobacterial origin of neomura (Eukaryotes, archaebacteria)”. 《Protoplasma》 257 (3): 621–753. doi:10.1007/s00709-019-01442-7. PMC 7203096. PMID 31900730. 
  6. ↑ Monique Aouad, Najwa Taïb, Anne Oudart, Michel Lecocq, Manolo Gouy,Céline Brochier-Armanet (2018년 4월 21일). “Extreme halophilic archaea derive from two distinct methanogen Class II lineages” (PDF). 《Molecular Phylogenetics and Evolution》 (Elsevier) 2018 (27): 46–54. doi:10.1016/j.ympev.2018.04.011. PMID 29684598. 
  7. ↑ Karen Andrade, Jörn Logemann, Karla B Heidelberg, Joanne B Emerson, Luis R Comolli, Laura A Hug, Alexander J Probst, Angus Keillar, Brian C Thomas, Christopher S Miller, Eric E Allen, John W Moreau, Jochen J Brocks & Jillian F Banfield (2015년 4월 28일). “Metagenomic and lipid analyses reveal a diel cycle in a hypersaline microbial ecosystem”. 《ISME J》. ISME J 9, 2697–2711 (2015) (12): 2697–2711. doi:10.1038/ismej.2015.66. PMC 4817636. PMID 25918833. 
  8. ↑ Rohit Ghai, Lejla Pašić, Ana Beatriz Fernández, Ana-Belen Martin-Cuadrado, Carolina Megumi Mizuno, Katherine D. McMahon, R. Thane Papke, Ramunas Stepanauskas, Beltran Rodriguez-Brito, Forest Rohwer, Cristina Sánchez-Porro, Antonio Ventosa & Francisco Rodríguez-Valera (2011년 10월 31일). “New Abundant Microbial Groups in Aquatic Hypersaline Environments”. 《Scientific Reports》 1 (Sci Rep 1, 135 (2011)): 135. Bibcode:2011NatSR...1E.135G. doi:10.1038/srep00135. PMC 3216616. PMID 22355652. 
  9. ↑ Vavourakis Charlotte D., Ghai Rohit, Rodriguez-Valera Francisco, Sorokin Dimitry Y., Tringe Susannah G., Hugenholtz Philip, Muyzer Gerard (2016년 2월 25일). “Metagenomic Insights into the Uncultured Diversity and Physiology of Microbes in Four Hypersaline Soda Lake Brines”. 《Frontiers in Microbiology》 7: 211. doi:10.3389/fmicb.2016.00211. PMC 4766312. PMID 26941731. 
  10. ↑ Olga Zhaxybayeva 1, Ramunas Stepanauskas, Nikhil Ram Mohan, R Thane Papke (2013년 1월 29일). “Cell sorting analysis of geographically separated hypersaline environments”. 《Extremophiles》. 17,2 (2013) (2): 265–275. doi:10.1007/s00792-013-0514-z. PMID 23358730. 2021년 3월 2일에 확인함. 
  11. ↑ Alexander Crits‐Christoph Diego R. Gelsinger Bing Ma Jacek Wierzchos Jacques Ravel Alfonso Davila M. Cristina Casero Jocelyne DiRuggiero (2016년 3월 21일). “Functional interactions of archaea, bacteria and viruses in a hypersaline endolithic community”. 《Environmental Microbiology》 18 (2016 v.18 no.6): 2064–2077. doi:10.1111/1462-2920.13259. PMID 26914534. 2021년 3월 2일에 확인함. 
  12. ↑ J.P. Euzéby. “Phylum "Candidatus Nanohaloarchaeota"”. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). 2011년 11월 17일에 확인함. 
  13. ↑ Sayers; 외. “Nanohaloarchaea”. National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. 2011년 6월 5일에 확인함. 
  14. ↑ La Cono; 외. (2020). “Symbiosis between nanohaloarchaeon and haloarchaeon is based on utilization of different polysaccharides”. 《Proc Natl Acad Sci USA》 117 (33): 20223–20234. Bibcode:2020PNAS..11720223L. doi:10.1073/pnas.2007232117. PMC 7443923. PMID 32759215. 
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