FASTA 포맷

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FASTA 포맷
파일 확장자.fasta, .fna, .ffn, .faa, .frn, .fa
인터넷 미디어 타입
text/x-fasta
UTI아니오
개발David J. Lipman
William R. Pearson[1][2]
발표일1985
포맷 종류생물정보학
다음으로부터 확장ASCII (FASTA용)
다음으로 확장FASTQ 포맷[3]
웹사이트www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/fasta.shtml

FASTA 포맷염기서열 혹은 단백질서열을 문자열로 표현한 것이다. 이 포맷은 FASTA 소프트웨어 패키지가 기원이지만 현재는 생물정보학 분야에서 표준에 가깝게 사용되고 있다.[4]

각주[편집]

  1. Lipman DJ, Pearson WR (March 1985). “Rapid and sensitive protein similarity searches”. 《Science》 227 (4693): 1435–41. Bibcode:1985Sci...227.1435L. doi:10.1126/science.2983426. PMID 2983426.  틀:Closed access
  2. Pearson WR, Lipman DJ (April 1988). “Improved tools for biological sequence comparison”. 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 85 (8): 2444–8. Bibcode:1988PNAS...85.2444P. doi:10.1073/pnas.85.8.2444. PMC 280013. PMID 3162770. 
  3. Cock PJ, Fields CJ, Goto N, Heuer ML, Rice PM (April 2010). “The Sanger FASTQ file format for sequences with quality scores, and the Solexa/Illumina FASTQ variants”. 《Nucleic Acids Research》 38 (6): 1767–71. doi:10.1093/nar/gkp1137. PMC 2847217. PMID 20015970. 
  4. “What is FASTA Format?”. 《zhanglab.ccmb.med.umich.edu》.  explains the FASTA format

외부 링크[편집]