나가사키 역사 문화 박물관(틀:Ja-y)은 일본 나가사키 현 나가사키 시에 있는 박물관이다. 나가사키 봉행소의 모습을 재현하였으며, 일본의 중요문화재를 비롯한 약 4만 8000여점이 전시되어 있다.