열린 번역 틀
분자유전학에서 열린 번역 틀(open reading frame, ORF)은 번역 틀의 한 종류로 종결 코돈이 없는 것을 말한다. 전사 종결자 정지 지점은 열린 번역 틀 다음에 위치하는데, 만약 전사가 종결 코돈 전에 멈추게 되면, 번역과정 동안 불완전한 단백질이 만들어 진다.[1] 일반적으로, 열린 번역 틀 지역의 시작코돈 이후의 삽입은 프레임쉬프트 돌연변이를 일으켜서 종결 코돈의 위치를 이동시키게 한다.
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[편집] 의미
열린 번역 틀의 일반적인 사용은 유전자 예측을 도와주는 하나의 증거로 쓸 수 있다. 긴 열린 번역 틀들은 단백질을 코딩하는 지역을 발견할 때, 종종 사용된다. [2] 열린 번역 특의 존재는 전사가 된다는 말을 의미하는 것은 아니다. 예를들어, 같은 비율의 각 뉴클레오타이드의 무작위적인 배열로 만들어진 DNA 서열은 종결 코돈이 매 21코돈마다 하나씩 나온다. [2] 원핵생물에서 시작코돈을 찾기 위한 단순한 유전자 예측 알고리즘은 일반적인 단백질을 암호화 하기에 충분히 길다.[2] 긴 열린 번역 틀은 결론적으로 긴 유전자를 지시하는 것은 아니다.[2]
[편집] 예
만약에 유전체가 5'-ATCTAAAATGGGTGCC-3'로 서열이 되어있으면, 열린 번역 틀은 세 가지의 가능성이 있다. 이 서열에서는 3개중에 2개의 가능한 번역 특이 열려있다. 그 말은 즉, 종결 코돈이 없다는 것을 말한다.
- ...A TCT AAA ATG GGT GCC...
- ...AT CTA AAA TGG GTG CC...
- ...ATC TAA AAT GGG TGC C...
DNA에서 가능한 종결 코돈은 "TGA", "TAA" 그리고 "TAG"이다. 그러므로, 위의 예에서 마지막 번역 틀은 종결 코돈인 TAA를 가지고 있다.
[편집] 주석
- ↑ Slonczewski, Joan, John Watkins Foster (2009). 《Microbiology: An Evolving Science》. New York: W.W. Norton & Co.. ISBN 978-0-393-97857-5
- ↑ 가 나 다 라 Deonier, Richard, Simon Tavaré, Michael Waterman (2005). 《Computational Genome Analysis: an introduction》. Springer-Verlag, 25쪽. ISBN 0-387-98785-1
[편집] 외부 링크
- Translation and Open Reading Frames
- NCBI ORF finder - A web based interactive tool for predicting and analysing ORFs from nucleotide sequences.
- ORF finder - A web based interactive tool for predicting and analysing ORFs from nucleotide sequences - hosted at bioinformatics.org
- hORFeome V5.1 - A web based interactive tool for CCSB Human ORFeome Collection
- ORF Marker - A free, fast and multi-platform desktop GUI tool for predicting and analyzing ORFs
- StarORF - A multi-platform, java based, GUI tool for predicting and analyzing ORFs and obtaining reverse complement sequence
