열린 번역 틀

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분자유전학에서 열린 번역 틀(open reading frame, ORF)은 번역 틀의 한 종류로 종결 코돈이 없는 것을 말한다. 전사 종결자 정지 지점은 열린 번역 틀 다음에 위치하는데, 만약 전사가 종결 코돈 전에 멈추게 되면, 번역과정 동안 불완전한 단백질이 만들어 진다.[1] 일반적으로, 열린 번역 틀 지역의 시작코돈 이후의 삽입은 프레임쉬프트 돌연변이를 일으켜서 종결 코돈의 위치를 이동시키게 한다.

의미[편집]

열린 번역 틀의 일반적인 사용은 유전자 예측을 도와주는 하나의 증거로 쓸 수 있다. 긴 열린 번역 틀들은 단백질을 코딩하는 지역을 발견할 때, 종종 사용된다. [2] 열린 번역 특의 존재는 전사가 된다는 말을 의미하는 것은 아니다. 예를들어, 같은 비율의 각 뉴클레오타이드의 무작위적인 배열로 만들어진 DNA 서열은 종결 코돈이 매 21코돈마다 하나씩 나온다. [2] 원핵생물에서 시작코돈을 찾기 위한 단순한 유전자 예측 알고리즘은 일반적인 단백질을 암호화 하기에 충분히 길다.[2] 긴 열린 번역 틀은 결론적으로 긴 유전자를 지시하는 것은 아니다.[2]

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만약에 유전체가 5'-ATCTAAAATGGGTGCC-3'로 서열이 되어있으면, 열린 번역 틀은 세 가지의 가능성이 있다. 이 서열에서는 3개중에 2개의 가능한 번역 특이 열려있다. 그 말은 즉, 종결 코돈이 없다는 것을 말한다.

  1. ...A TCT AAA ATG GGT GCC...
  2. ...AT CTA AAA TGG GTG CC...
  3. ...ATC TAA AAT GGG TGC C...

DNA에서 가능한 종결 코돈은 "TGA", "TAA" 그리고 "TAG"이다. 그러므로, 위의 예에서 마지막 번역 틀은 종결 코돈인 TAA를 가지고 있다.

주석[편집]

  1. Slonczewski, Joan, John Watkins Foster (2009). 《Microbiology: An Evolving Science》. New York: W.W. Norton & Co.. ISBN 978-0-393-97857-5
  2. Deonier, Richard, Simon Tavaré, Michael Waterman (2005). 《Computational Genome Analysis: an introduction》. Springer-Verlag, 25쪽. ISBN 0-387-98785-1

외부 링크[편집]

  • Translation and Open Reading Frames
  • NCBI ORF finder - A web based interactive tool for predicting and analysing ORFs from nucleotide sequences.
  • ORF finder - A web based interactive tool for predicting and analysing ORFs from nucleotide sequences - hosted at bioinformatics.org
  • hORFeome V5.1 - A web based interactive tool for CCSB Human ORFeome Collection
  • ORF Marker - A free, fast and multi-platform desktop GUI tool for predicting and analyzing ORFs
  • StarORF - A multi-platform, java based, GUI tool for predicting and analyzing ORFs and obtaining reverse complement sequence