실시간 중합효소연쇄반응

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분자생물학에서, 실시간 중합효소연쇄반응(Real-time polymerase chain reaction, real-time PCR, quantitative real time polymerase chain reaction, qPCR)은 중합효소 연쇄 반응을 기반으로한 실험방법이다. 실시간 중합효소연쇄반응은 목표 DNA분자의 증폭과 양의 측정을 동시에 한다. DNA샘플에서 하나 또는 그 이상의 특정 서열을 위해, 실시간 중합효소연쇄반응은 검출과 양의 측정을 할 수 있게한다. 계량은 절대적인 복제 수 또는 상대적인 양을 셀 수 있다.

실험의 진행은 일반적인 중합효소연쇄반응을 따른다; 중요한 특징은, 증폭된 DNA가 실시간으로 측정된다는 것이다. 이 점이 마지막에서 DNA가 관측이 되는 기본적인 중합효소연쇄반응과의 차이점이다. 두가지의 일반적인 방법이 실시간 중합효소연쇄반응에서 사용된다. (1) 아무 DNA이중나선에 끼어들어갈 수 있는 불특정한 형광염색, (2) 올리고뉴클레오티드로 이루어진 서열-특이적 DNA탐침, 형광으로 보고자가 라벨되어있고, 상보적인 DNA목표에 결합한 뒤 검출된다.

종종, 실시간 중합효소연쇄반응은 세포 또는 조직의 mRNA와 non-coding RNA를 수량화하기 위해 역전사 중합연쇄반응과 결합되어 행해진다.

실시간 중합효소연쇄반응의 줄인말로 qPCR이란 말도 쓰인다.[1] 실시간 중합효소연쇄반응은 종종 qRT-PCR로 불리기도 한다.[2][3][4] "RT-PCR"로 일반적으로 불리는 것은 역전사 중합연쇄반응(reverse transcription polymerase chain reaction)을 말하며, 실시간 중합효소연쇄반응(real-time PCR)이 아니다. 그러나 모든 저자들이 이 관습에 집착하지는 않는다.[5]

주석[편집]

  1. VanGuilder HD, Vrana KE, Freeman WM (2008년). Twenty-five years of quantitative PCR for gene expression analysis. 《Biotechniques》 44 (5): 619–626. PMID 18474036. doi:10.2144/000112776.
  2. Udvardi MK, Czechowski T, Scheible WR (2008년). Eleven Golden Rules of Quantitative RT-PCR. 《Plant Cell》 20 (7): 1736–1737. PMID 18664613. doi:10.1105/tpc.108.061143.
  3. Spackman E, Suarez DL (2008년). Type A influenza virus detection and quantitation by real-time RT-PCR. 《Methods Mol Biol》 436: 19–26. PMID 18370037. doi:10.1007/978-1-59745-279-3_4.
  4. Gertsch J, Güttinger M, Sticher O, Heilmann J. (2002년). Relative quantification of mRNA levels in Jurkat T cells with RT-real time-PCR (RT-rt-PCR): new possibilities for the screening of anti-inflammatory and cytotoxic compounds. 《Pharm Res》 19 (8): 1236–1243. PMID 12240952. doi:10.1023/A:1019818814336.
  5. edited by Julie Logan, Kirstin Edwards, and Nick Saunders. (2009). 《Real-Time PCR: Current Technology and Applications》. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-39-4