시보루토 기념관(シーボルト記念館)은 일본 나가사키 현 나가사키 시에 있는 박물관이다. 1989년 문을 열었으며, 필리프 프란츠 폰 지볼트를 기념하기 위해 세워졌다. 벽돌로 지어졌으며, 네덜란드 라이덴 시에 있는 지볼트의 구 저택을 모티프로 하여 지어졌다.
좌표: 북위 32° 45′ 21″ 동경 129° 53′ 32″ / 북위 32.755839° 동경 129.892214° / 32.755839; 129.892214